เชื้อไวรัสโรคซาร์ส

โดย: PB [IP: 178.218.167.xxx]
เมื่อ: 2023-06-07 17:55:03
การศึกษาแบบสหวิทยาการนี้ตีพิมพ์ในInternational Journal of Molecular Sciencesนำโดย Carlos J. Ciudad และ Verónica Noe จากคณะเภสัชศาสตร์และวิทยาศาสตร์การอาหาร และสถาบันนาโนศาสตร์และนาโนเทคโนโลยี (IN2UB) ของมหาวิทยาลัยบาร์เซโลนา Ramón Eritja, Anna Aviñó, Lluïsa Vilaplana และ M. Pilar Marco จาก IQAC-CSIC และ CIBER of Bioengineering, Biomaterials and Nanomedicine (CIBER-BBN); Manuel Gutiérrez, Antoni Baldi และ César Fernández จาก IMB-CNM-CSIC และ Valeria Grazu และ Jesús Martínez นักวิจัยของ CSIC จาก Institute of Nanoscience and Materials และ Aragón INMA (CSIC-UNIZAR) และ CIBER-BBN การศึกษาดำเนินการในบริบทของโครงการ PoC4CoV ซึ่งนำโดย M. Pilar Marco และ César Fernández และได้รับทุนสนับสนุนผ่าน Global Health Platform (PTI) ของ CSIC การศึกษาวิจัยยังคงดำเนินต่อไปโดยเป็นส่วนหนึ่งของโครงการที่ได้รับทุนสนับสนุนจาก La Marató de TV3 2020 เพื่อต่อสู้กับ COVID-19 ซึ่งมีผู้เชี่ยวชาญจากคณะเคมีของ UB เข้าร่วมด้วย กิ๊บโพลีพิวรีนเพื่อจับ RNA ของไวรัส วิธีการใหม่นี้ขึ้นอยู่กับความสามารถของโพลิพิวรีนแฮร์พิน (PPRHs) ซึ่งออกแบบโดยกลุ่มบำบัดมะเร็งของ UB ในการจับ RNA ของไวรัสและสร้างสารไตรเพล็กซ์ที่มีความสัมพันธ์สูง เมื่อโครงสร้างแบบผสมนี้เชื่อมต่อกับโพรบโมเลกุลและสัมผัสกับตัวอย่างจากผู้ป่วยที่ได้รับผลกระทบ จะได้สัญญาณการตรวจจับของตัวแทนไวรัส วิธีการที่นำเสนอในสิ่งพิมพ์ทางวิทยาศาสตร์เรียกว่า Triplex Enhanced Nucleic Acid Detection Assay (TENADA) "PPRHs เป็นกิ๊บดีเอ็นเอสายเดี่ยวที่ไม่ได้ดัดแปลงซึ่งประกอบด้วยโดเมนสเปกกูลาร์สองโดเมนของโพลีพิวรีนที่ขนานกัน โดเมนเหล่านี้เชื่อมต่อกันโดยห่วงไทมิดีน เชื่อมโยงกันด้วยพันธะรีเวิร์ส-โฮกสทีนภายในโมเลกุล กิ๊บโมเลกุลสามารถจับเฉพาะกับลำดับโพลีไพริมิดีนในตัวเดียว -stranded DNA (ssDNA), double-stranded DNA (dsDNA) หรือ RNA ไวรัสผ่านพันธะ Watson-Crick โรคซาร์ส จึงก่อตัวเป็นสามขนานที่ขนานกัน" ศาสตราจารย์ Carlos J. Ciudad จากภาควิชาชีวเคมีและสรีรวิทยาของ UB กล่าว วิธีการที่มีประสิทธิภาพและรวดเร็วกว่าการทดสอบ PCR ข้อได้เปรียบในการตรวจหา RNA ของไวรัสคือสามารถใช้วิธีการ PPRH ได้โดยไม่ต้องมีการแทรกแซงของรีเวิร์สทรานสคริปเทส ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่เปลี่ยน RNA เป็น DNA หรือเทอร์โมไซเคิล (อุปกรณ์ที่ขยายตัวอย่างสารพันธุกรรมด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอเรส หรือ PCR) นอกจากนี้ยังมีความไวและความจำเพาะเทียบเท่าการทดสอบ PCR และสามารถให้ผลในเวลาน้อยกว่าหนึ่งชั่วโมง ส่วนหนึ่งของการศึกษานี้ ทีมงานได้ใช้กลยุทธ์การผสมพันธุ์แบบแซนวิชในอุปกรณ์ตรวจจับทางชีวภาพหลายชิ้น กลยุทธ์นี้ใช้โอลิโกนิวคลีโอไทด์สองตัว: กิ๊บ PPRH ที่ขึ้นรูปสามชั้นทำหน้าที่เป็นโพรบจับและโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่สร้างเพล็กซ์ที่มีป้ายกำกับซึ่งทำหน้าที่เป็นโพรบตรวจจับ "กิ๊บ PPRH ที่ก่อตัวเป็นสามเท่าถูกออกแบบมาเพื่อจับกับลำดับของโพลีไพริมิดีนของ SARS-CoV-2 ในขณะที่โพรบตรวจจับได้รับการออกแบบให้เสริมกับบริเวณที่ใกล้กับตำแหน่งเป้าหมายของโพลีไพริมิดีน ดังนั้น การมีอยู่ของ SARS-CoV-2 RNA ถูกตรวจพบโดยการก่อตัวของ ternary complex บนพื้นผิวของไบโอเซนเซอร์" ศาสตราจารย์ Verónica Noé (UB-IN2UB) กล่าว วิธีการนี้ถูกนำมาใช้ในอุปกรณ์ไฟฟ้าเคมีขนาดกะทัดรัดที่รวมเซลล์ไฟฟ้าเคมีสองขั้วไว้บนชิป ซึ่งผลิตใน IMB-CNM-CSIC Micro and Nanofabrication Clean Room และส่วนประกอบของไหลบนกระดาษ และในด้านข้างระบายความร้อน ระบบการไหลนำมาใช้ในไนโตรเซลลูโลสและใช้อนุภาคนาโนพลาสโมนิกและกระดาษความร้อนซึ่งได้รับการพัฒนาที่ INMA (CSIC-UNIZAR) TENADA: การประยุกต์ใช้ในการวิจัยทางชีวการแพทย์ PPRHs ถูกอธิบายไว้ในเอกสารทางวิทยาศาสตร์ว่าเป็นเครื่องมือสำหรับการยับยั้งยีนของยีนหลายตัวที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งเป็นหลัก นอกจากนี้ยังรวมเป็นหัววัดในไบโอเซนเซอร์สำหรับตรวจจับโมเลกุล RNA ขนาดเล็ก (miRNA) เพื่อระบุสถานะของ DNA methylation และสำหรับการวินิจฉัยโรคปอดบวมที่เกิดจากเชื้อรา Pneumocystis jirovecii ตอนนี้ วิธีการใหม่ของ TENADA พิสูจน์แล้วว่ามีประสิทธิภาพ ไม่เพียงแต่ในการตรวจจับอนุภาคของไวรัสเท่านั้น ความสัมพันธ์สูงของ PPRHs สำหรับ RNA ของไวรัสเป็นคุณสมบัติที่สามารถนำไปใช้เพื่อยับยั้งกระบวนการจำลองแบบของไวรัส ด้วยเหตุนี้ คุณสมบัติต้านไวรัสของกิ๊บหนีบโพลีพิวรีน CC1PPRH และ CC2PPRH ในเซลล์ของสายเลือด VeroE6 ที่ติดเชื้อ SARS-CoV-2 virions ก็ได้รับการศึกษาด้วยเช่นกัน

ชื่อผู้ตอบ:

Visitors: 1,714,586